Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP2Q9NS61 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms