Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP3Q9NS15 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms