Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX15Q9NRS6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms