Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TULP4Q9NRJ4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP4Q9NRJ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms