Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms