Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX8Q9HC52 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms