Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms