Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms