Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms