Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms