Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms