Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms