Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM31Q9BZY9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms