Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS3Q9BZE2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms