Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUF2Q9BZD4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUF2Q9BZD4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.5 ms