Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIH1Q9BYX4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms