Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PCGF6Q9BYE7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms