Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3Q9BY71 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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