Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms