Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRIP1Q9BX63 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms