Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms