Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MXD3Q9BW11 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MXD3Q9BW11 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms