Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms