Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms