Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBM42Q9BTD8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms