Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms