Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG2

NUDT12, Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT12Q9BQG2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDT12Q9BQG2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDT12Q9BQG2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms