Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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