Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms