Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX18Q96RF0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX18Q96RF0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms