Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNAQ96QF7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms