Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms