Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMTK3Q96Q04 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms