Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms