Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC115Q96NT0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms