Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOX2Q96NM4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOX2Q96NM4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms