Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC3BQ96NL0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms