Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD1Q96MW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD1Q96MW7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD1Q96MW7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD1Q96MW7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD1Q96MW7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD1Q96MW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD1Q96MW7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD1Q96MW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIGD1Q96MW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms