Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NSMCE2Q96MF7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms