Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP47Q96K76 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms