Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms