Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
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