Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEIL1Q96FI4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms