Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms