Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms