Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102AQ96A19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC102AQ96A19 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms