Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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TRIM63Q969Q1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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