Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms