Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms