Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP13Q92995 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP13Q92995 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP13Q92995 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP13Q92995 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP13Q92995 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP13Q92995 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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